Année 2059. Sheryl Nome arrive sur la flotte Macross Frontier pour clôturer sa tournée dans les flottes coloniales des NUNS. Pendant le concert, de mystérieux extraterrestres attaquent la flotte. Alto Saotome vient au secours de la jeune femme qui tombe littéralement du ciel. Le jeune homme fait peu après ses débuts dans le SMS. Parallèlement, Ranka Lee, une autre connaissance d'Alto, fait ses premiers pas en tant que chanteuse, elle aussi.